Modele anatomiczne czaszki odgrywają niebagatelną pracę w edukacji medycznej, badaniach naukowych także w praktyce medycznej. Ich znaczenie pochodzi z konieczności precyzyjnego poznania budowy czaszki, jaka jest jednym spośród znacznie skomplikowanych elementów ludzkiego szkieletu. Modele anatomiczne dają one na precyzyjne przestudiowanie układu kostnego, wzajemnych relacji pomiędzy niektórymi elementami czaszki także na ciekawsze zrozumienie mechanizmów urazów, deformacji i wady. Modele anatomiczne czaszki są też szeroko wykorzystywane w stomatologii. Budowa czaszki ma kluczowe znaczenie w diagnostyce i pomaganiu zaburzeń jamy ustnej, wad zgryzu czy problemów ortodontycznych. W ortodoncji modele anatomiczne czaszki pomagają w ocenie struktury żuchwy i szczęki, co pozwala dokładne zaplanowanie leczenia aparatami ortodontycznymi. Nie bez znaczenia są też modele anatomiczne czaszki w medycynie sądowej i antropologii.
Modele anatomiczne czaszki, które różnią się stopniem szczegółowości także materiałem wytworzenia. Jednym spośród wysoce istotnych typów są zwykłe modele anatomiczne czaszki ludzkiej, przedstawiające podstawowe kości i ich powiązania. Modele anatomiczne tego rodzaju są powszechnie wykorzystywane w szkolnictwie i służą do nauki podstawowej anatomii czaszki. Inną grupę stanowią modele anatomiczne czaszki z ruchomymi elementami, które zapewniają na lepsze zrozumienie połączeń pomiędzy kośćmi oraz mechanizmów ich ruchu, co jest wyjątkowo pomocne w stomatologii i chirurgii szczękowej. W znacznie zaawansowane modele anatomiczne czaszki mogą być rozkładane na pojedyncze kości, co umożliwia na dokładne badanie niektórych elementów. Dzięki temu wolno zobaczyć, w jaki sposób poszczególne kości są ze sobą powiązane, jakie mają kształty oraz jakie struktury anatomiczne się na nich znajdują. Tego rodzaju modele anatomiczne są niezwykle pomocne w szkole anatomii i chirurgii, ponieważ umożliwiają dokładną analizę struktur trudnych do zobaczenia w rzeczywistej czaszce. Nowym rodzajem są modele anatomiczne czaszki z zaznaczonymi strukturami anatomicznymi, które pomagają w edukacji szczegółowej anatomii. W takich modelach drugie czynniki czaszki są zaznaczone barwami, co ułatwia ich identyfikację. Na przykład kości tworzące podstawę czaszki mogą być podkreślone różnym odcieniem niż kości sklepienia, a kanały nerwowe i otwory mogą być wyróżnione w sposób sprzyjający ich zapamiętanie. Jest to zwłaszcza odpowiednie dla uczniów medycyny, jacy muszą opanować trudną terminologię anatomiczną. Dla bardziej zaawansowanych użytkowników dostępne są modele anatomiczne czaszki z odwzorowanymi strukturami nerwowymi i naczyniowymi. Tego rodzaju modele anatomiczne mają przebieg nerwów czaszkowych oraz naczyń krwionośnych, co jest niebywale istotne w nauce neuroanatomii i neurochirurgii. Dzięki nim wolno prześledzić ścieżki przebiegu nerwów, ich położenie względem struktur kostnych także miejsca, w jakich mogą być one uciskane lub uszkadzane. Nowa technika pozwala też na kształtowanie projektów czaszki w technologii druku 3D. Modele anatomiczne te mogą być produkowane na bazie prawdziwych danych tomograficznych, co umożliwia na odwzorowanie indywidualnych cech anatomicznych pacjenta. Takie modele anatomiczne są wyjątkowo pomocne w planowaniu operacji chirurgicznych, ponieważ umożliwiają lekarzom wcześniejsze przećwiczenie technologii na określonym odwzorowaniu czaszki pacjenta. Technika ta jest też używana w rekonstrukcji twarzy w przypadkach urazów oraz deformacji wrodzonych.
